koisenさまこんにちは。朧月夜に舞う胡蝶と申します。
横から失礼します。
イラスタやコミスタのトーンファイル（tne形式）のクリスタへの読み込みについては
クリスタ機能一覧にあるとおり2012年秋 （パワートーンの読み込みは2012年冬以降） に
予定されていますので、次回のアップデートなど近いうちに対応されることになるかと。
（わたしは株式会社セルシスさまの中の人ではありませんから、
確かなことは申し上げられませんが）
それと現在のクリスタでイラスタやコミスタのトーンをお使いになりたい場合は
－－－－－－－－－－－－－－－－－－－－－－－－－－－－－－－－－－－－－－－－－－－－－－－－－
1.イラスタやコミスタを立ち上げ、適当な大きさのキャンバスを新規作成
2.クリスタで使いたいトーンを使用
（トーンがシームレスの場合はトーン使用後にシームレスになるようトリミング）
3.クリスタで読めるファイル形式 （pngやbmp、psdなど） で保存
4.クリスタで（3）で保存したファイルを読み込み、「編集」→「画像を素材として登録」を選択
5.素材名に適当な名前を設定したあと、必要なら「タイリング」にチェックを入れ
任意の素材保存先を選択後「OK」でダイアログから抜ける
－－－－－－－－－－－－－－－－－－－－－－－－－－－－－－－－－－－－－－－－－－－－－－－－－
といった方法でトーン登録されるとよろしいかと。
以上、取り留めのないことをだらだらと述べてきましたが、少しでも参考になりましたら幸いです。
乱文失礼いたしました。